由臨床醫學研究所及運動醫學系共同協同合作發展的團隊，以此為基石，加上高雄醫學大學附設中和醫院以及與高雄應用科技大學電機工程學系與電子工程學系的配合，在培養具有產業效益產出能力之醫學工程專長之學生，其本學位學程之發展方向將朝向：

（一）醫學電子與影像

本學程發展之首要重點將運用電機、機械、電子、資訊的工程知識與技術，協助整合基礎醫學 (例如神經科學、針灸科學)、臨床醫學、醫療電子、復建工程、生物基因、生物力學與生醫材料之研究，與臨床診斷、醫療、復健儀器之研發與改進，包括醫學影像品質及解析系統之發展、醫學影像診斷輔助系統、醫療電子儀器輔具及輻射偵測儀器之開發，進而著重於整合型醫療系統之開發研究。

（二）生醫材料

在生醫材料方面，本所將著重於醫用奈米材料、高分子、金屬、陶瓷、複合材料、及生物高分子材料應用之開發與研製，材料生物適應性分析理論與實際之建立，藥物包膜與微球體材料之開發，生物可分解性材料之研製。

（三）生物力學

包含骨科生物力學、復健生物力學、運動生物力學和牙科生物力學等。例如：人工髖/膝關節置換手術，人工關節的研究相當具有潛力。針對國人常發生的膝關節炎病人，進行臨床治療成效的探討。輔具研發、人體動作分析及運動傷害機制探討也是未來發展重點。

（四）醫學資訊

生物醫學資訊為當今一跨領域之熱門科技，將以醫療網路與遠端照護平台應用、資訊安全技術研發、網路與通訊建構、生物資訊、人工智慧及資料探勘等為發展方向。

（五）臨床工程

強化醫工等科技在臨床之應用；充分利用高醫大及附設醫院相關資源，建構完整的臨床與基礎雙向研究所需之互動平台。